2002年6月29日，我國第一部關于科普的法律——《中華人民共和國科學技術普及法》正式頒布實施。2003年6月29日，在《科普法》頒布一周年之際，為在全國掀起宣傳貫徹落實《科普法》的熱潮，中國科協在全國范圍內開展了一系列科普活動。自此，中國科協每年都組織全國學會和地方科協在全國開展科普日活動。從2005年起，為便于廣大群眾、學生更好地參與活動，活動日期由原先的6月份改為每年9月第三個公休日，作為全國科普日活動集中開展的時間。
一直以來，全國科普日活動都得到了中央領導同志，特別是中央書記處的高度重視和關心。自2004年全國科普日活動以來，中央書記處領導同志每年都蒞臨全國科普日北京活動現場，與首都各界群眾一起參與科普日活動，起到了很好的表率作用。全國各地主要黨政領導也都參加當地的科普日活動。
2009年底，中央書記處在聽取中國科協黨組工作匯報的時候，進一步明確要繼續(xù)辦好全國科普日活動，并且提出“中央書記處全體同志都要繼續(xù)參加全國科普日活動”，進一步體現了中央領導對全國科普日活動的關心、重視和支持。
